Petit arxipèlag que representa la prolongació del massís del Montgrí, situat a menys d’una milla del litoral, a l'alçada de l’Estartit.

La vegetació, capaç de fer front a les dures condicions de vent i salinitat, és molt escassa, i el substrat arbori del tot inexistent.

La presència històrica de l’home a les Illes Medes explica la presència de ratolins Mus musculus i de plantes exòtiques com ara les figues de moro Opontia ficus-indica, els garrofers Ceratonia suiliqua i les ungles de gat Carpobrotus edulis, que comparteixen l'espai amb el fonoll marí Chritmum maritimum i la pastanaga marina Daucus gingidum, entre d' altres.

El fons marí presenta una riquesa i una diversitat excepcionals. Hi destaquen els alguers de posidònia i les comunitats de gorgònies i corall vermell.